Masjid Al Muhajirin adalah salahsatu masjid tua di Kota Gresik, didirikan pada tahun 1236 H/1821 M. oleh satu keluarga saudagar berasal dari Yaman. Terletak di jalan KH. Zubair No. 54 Kota Gresik, kawasan yang dikenal sebagai Kampoeng Arab Gresik. Seiring usianya yang sudah mencapai lebih dari 200 tahun, Masjid ini telah melalui beberapa kali pemugaran, dan pemugaran terakhir pada tahun 2003 M.

Penamaan masjid ini sebagaimana terdapat pada catatan tahun pendiriannya yang terdapat pada tulisan kaligrafi kayu ukir disalahsatu pintu utama dilatarbelakangi dari pesan suci dari kesemangat peristiwa hijrah Baginda Agung Nabi Muhammad SAW ke Madinah bersama para sahabat-sahabatnya. Dari semangat dan pesan suci peristiwa hijrah itupula Masjid Al Muhajirin sejak pertama didirikannya dikelola dalam bingkai ukhuwah islamiyah ala manhaji ahlis sunnah waljamaah, tanpa berafiliasi pada ormas, lembaga, atau aliran politik apapun. Hal itu dilakukan untuk memastikan posisi Masjid Al Muhajirin terus menjadi perekat ukhuwah dikalangan umat dan persatuan bangsa.

Setelah melalui sebuah perjalanan panjang sebagai masjid yang menjadi salahsatu tempat ibadah, dalam rangka memperluas manfaat dan peran baik yang ditebarkan para pengelola Wakaf Masjid Al Muhajirin membentu sebuah yayasan sebagai payung hukum, dengan nama Yayasan Masjid Al Muhajirin (YAMAMU). Kini YAMAMU berkembang menjadi community center yang terus melayani dan menebar manfaat bagi masyarakat sekitar. Berangkat dari harapan dan kebutuhan masyarakat, pada tahun 2005, YAMAMU merintis program pendidikan Alquran yaitu Taman Pendidikan Alquran (TPQ) sebagai wadah belajar Alquran dan praktik ubudiyah bagi anak-anak sekitar. Dalam perkembangan selanjutnya, pada tahun 2012 dimulai pembangunan sebuah gedung dan dibentuk lembaga otonom yang menyelenggarakan kegiatan pendidikan dan sosial yaitu MUHAJIRIN CENTER (MC).  MC mulai aktif melaksanakan kegiatan dan melakukan perintisan program-program pendidikan dan sosial mulai tahun 2015 hingga sekarang.